Инкерманский пещерный монастырь считается один из самых старых пещерных монастырей Крыма. Находится Инкерманский пещерный монастырь в Крыму недалеко от Севастополя, в Инкермане. Временем основания Инкерманского пещерного монастыря принято считать достаточно большой промежуток времени: от VIII – IX веков. Возникновение Инкерманского пещерного монастыря связывают с именем римского епископа святого Климента, который был сослан в Крым, в каменоломни недалеко от Инкермана, за свои христианские проповеди. Здесь, в Крыму в 101 году Климент был убит. Мощи святого Климента были обнаружены спустя год после смерти святого, недалеко от Херсонеса, в подводном гроте.

Всего в инкерманских скалах в Крыму было обнаружено свыше 30 пещерных церквей и 9 монастырских комплексов. Историки выдвигают гипотезу, что в средневековом Крыму, здесь в Инкермане, находился монашеский центр, как Афон в Греции.
Один из сохранившихся пещерных монастырей Инкермана расположен в Загайтанской скале, еще один монастырь – в устье Каменоломенной балки, третий, из сохранившихся пещерных монастырей Крыма был высечен в Монастырской скале, в честь святого Климента. В XV после захвата крепости Каламита турками, Инкерманский пещерный монастырь пришел в упадок. Только в XIX веке монастырь стал возрождаться, и был переименован в честь святого Климента. Также был снова открыт храм святого Мартина, построен храм великомученика Пантелеимона и церковь в стиле поздневизантийского зодчества св. Николая Мирликийского.

C приходом советской власти храмы Инкерманского пещерного монастыря стали закрываться. В 1991 года начинается постепенное возрождение Инкерманского пещерного монастыря, восстанавливают храмы и кельи. На сегодняшний день в Инкерманском монастыре пещерные храмы: Климентовский, Андреевский, Мартиновский являются действующими. Из Киева в возрождающийся Инкерманский пещерный монастырь передали частицу мощей святого Климента, которая была установлена в Свято-Климентовском храме.